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伯豪生物
文獻集錦│2021 年度 1 月 - 2 月 ceRNA 研究匯總
發(fā)布時間:2021-03-03 瀏覽次數:5598
已知microRNA可以通過結合mRNA導致基因沉默,而ceRNA可以通過競爭性地結合microRNA來調節(jié)基因表達。ceRNA可以通過應答元件(microRNA response elements,MREs)與microRNA結合從而影響microRNA導致的基因沉默。

已知 microRNA 可以通過結合 mRNA 導致基因沉默,而 ceRNA 可以通過競爭性地結合 microRNA 來調節(jié)基因表達。ceRNA 可以通過應答元件(microRNA response elements,MREs) 與 microRNA 結合從而影響 microRNA 導致的基因沉默。如:miRNA 可通過抑制目的基因 mRNA 的翻譯,或促進 mRNA 降解來起到負調控的作用,而另一些 RNA,如 circRNA,能夠像海綿一樣吸收、結合 miRNA,使其不能發(fā)揮負調控的作用,從而促進靶基因的表達。


1


ceRNA 機制示意圖

ceRNA 調控機制近年來一直是研究熱點,2021 年 1 月~2 月 PubMed 上可檢索到的文章就有 375 篇,其中超過 5 分的文章小編已經為大家整理好啦,詳細信息見文末附表,讓您不用再費時費力搜索,就能輕松獲取新的 ceRNA 機制研究成果和動態(tài)。小編挑出以下 5 篇作為重點分享內容。


文章展示

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標題:環(huán)狀 RNA circSDHC 充當 miR-127-3p 的海綿,通過 CDKN3/ E2F1 軸促進腎細胞癌的增殖和轉移

期刊:Mol Cancer.

影響因子:15.302

發(fā)表時間:2021.01.20

單位:中山大學附屬第一醫(yī)院

摘要:越來越多的證據表明,環(huán)狀 RNA(circRNA)在癌癥的發(fā)生和發(fā)展中起著重要的調節(jié)作用。但是 circRNA 在腎細胞癌(RCC)中的表達模式和生物學功能尚不清楚。該研究利用生物信息學方法篩選在 RCC 中差異表達的 circRNA,在線 circRNAs 芯片數據集和研究者自己的患者隊列的分析表明,circSDHC(hsa_circ_0015004)在 RCC 中具有潛在的致癌作用。通過 qPCR 測量 RCC 組織和細胞系中的 circSDHC 表達,并評估 circSDHC 的預后價值;此外進行了一系列功能性體外和體內實驗,以評估 circSDHC 對 RCC 增殖和轉移的影響。RNA pull-down 測定,熒光素酶報告基因和熒光原位雜交測定確認 circSDHC,miR-127-3p 及其靶基因之間的相互作用。研究結果顯示:臨床上,circSDHC 的高表達與 RCC 患者的 TNM 分期晚期和生存不良有關。此外,circSDHC 在體內和體外均促進腫瘤細胞的增殖和侵襲,對 circSDHC 在 RCC 中作用的潛在機制的分析表明,它與 miR-127-3p 競爭性結合并阻止其抑制下游基因 CDKN3 和 E2F1 途徑,從而導致 RCC 惡性進展。敲低 circSDHC 會導致 CDKN3 表達降低和 E2F1 途徑抑制,這可以通過用 miR-127-3p 抑制劑來挽救。該研究數據初次表明 circSDHC/ miR-127-3p/ CDKN3/ E2F1 軸在 RCC 進展中起著至關重要的作用,因此 circSDHC 有望成為 RCC 患者的新治療靶點。


2

標題:三陰性乳腺癌中 CircNR3C2 通過海綿化 miR-513a-3p 促進 HRD1 介導的腫瘤抑制作用

期刊:Mol Cancer.

影響因子:15.302

發(fā)表時間:2021.02.02

單位:南京醫(yī)科大學附屬逸夫醫(yī)院

摘要:E3 泛素連接酶 HRD1 在乳腺癌中被下調并起抑癌作用,而 HRD1 在不同乳腺癌亞型中的確切表達特征仍然未知。近的研究表征了環(huán)狀 RNA(circRNA)在腫瘤進展中起 miRNA 海綿的調控作用,為癌癥相關基因的轉錄后調控提出了新觀點。該研究使用公共芯片 / RNA 測序數據集和乳腺癌組織 / 細胞系檢測 HRD1 蛋白和 mRNA 的表達。基于公共 RNA 測序結果,在線數據庫和富集 / 聚類分析預測可能調節(jié) HRD1 表達的 circRNA/miRNA 的關系對。體內和體外的功能獲得性和挽救實驗,評估 circNR3C2 通過 HRD1 介導的波形蛋白蛋白酶體降解對乳腺癌進展的抑制作用。HRD1 在三陰性乳腺癌(TNBC)中相對于其他亞型而言明顯低表達,并且與波形蛋白呈負相關,通過誘導多聚泛素化作用抑制乳腺癌細胞的增殖、遷移、侵襲和 EMT(上皮間質轉化)過程,介導的波形蛋白的蛋白酶體降解。在 TNBC 中,CircNR3C2(hsa_circ_0071127)也顯著下調,與浸潤性乳腺癌的遠處轉移和致死率負相關。通過在海綿吸附體內表達 miR-513a-3p,在體外和體內過表達 circNR3C2 會增強 HRD1 的腫瘤抑制作用。該研究闡明了 circNR3C2/miR-513a-3p/HRD1/Vimentin 軸負調節(jié) TNBC 轉移,表明 circNR3C2 和 HRD1 可以作為潛在的預后生物標志物,可促進針對侵襲性乳腺癌患者的 circNR3C2 和 HRD1 的治療劑的開發(fā)。



3

標題:circEHBP1 通過 miR-130a-3p /TGFβR1/ VEGF- D 信號傳導促進膀胱癌的淋巴管生成和淋巴轉移

期刊:Mol Ther.

影響因子:8.986

發(fā)表時間:2021.02.03

單位:中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院

摘要:淋巴轉移是膀胱癌復發(fā)和死亡的主要原因。越來越多的證據表明,淋巴管生成是觸發(fā)淋巴轉移所必不可少的。但是,具體機制了解甚少。本研究揭示了一種參與膀胱癌淋巴轉移的途徑,其中環(huán)狀 RNA(circRNA)以獨立于血管內皮生長因子 C(VEGF-C)的方式促進淋巴管生成。新型 circRNA circEHBP1 在膀胱癌中顯著上調,與淋巴結轉移和膀胱癌患者預后不良呈正相關。CircEHBP1 通過與 miR-130a-3p 結合并拮抗 miR-130a-3p 對 TGFBR1 的 3'UTR 區(qū)的抑制作用,上調了轉化生長因子 β 受體 1(TGFBR1)的表達。隨后,circEHBP1 介導的 TGFβR1 過表達激活了 TGF-β/ SMAD3 信號通路,從而促進了 VEGF- D 的分泌并驅動膀胱癌的淋巴管生成和淋巴轉移。重要的是,體內施用 VEGF- D 中和抗體可顯著阻斷 circEHBP1 誘導的淋巴管生成和淋巴轉移。研究結果表明,circEHBP1/miR-130a-3p /TGFβR1/ VEGF- D 軸有助于膀胱癌的淋巴管生成和淋巴轉移,而與 VEGF- C 無關,表明 circEHBP1 可用于膀胱癌淋巴轉移的潛在的生物標志物和治療靶標。



4

標題:MSC 誘導的 lncRNA AGAP2-AS1 通過調節(jié)乳腺癌中的 CPT1 表達和脂肪酸氧化來促進干性和曲妥珠單抗抗性

期刊:Oncogene

影響因子:7.971

發(fā)表時間:2021.01

單位:海南醫(yī)科大學附屬醫(yī)院

摘要:曲妥珠單抗耐藥性已成為治療 HER- 2 陽性乳腺癌患者的主要障礙,越來越多的證據表明,間充質干細胞(mesenchymal stem cells, MSCs) 在耐藥形成過程中發(fā)揮重要作用,但其作用機制尚不清楚;研究通過質譜、RNA pull down 和 RNA 免疫沉淀等方法驗證 AGAP2-AS 與其他相關靶標(human antigen R (HuR)、miR-15a-5p、carnitine palmitoyl transferase 1 (CPT1)) 之間的直接相互作用。進行體外和體內實驗測定以闡明 AGAP2-AS1 在曲妥珠單抗抗性,干性和脂肪酸氧化(FAO)中的功能作用。結果顯示間充質干細胞共培養(yǎng)可誘導曲妥珠單抗耐藥性。在 msc 培養(yǎng)的細胞中,AGAP2-AS1 表達上調,而 AGAP2-AS1 的下調逆轉了 msc 介導的曲妥珠單抗耐藥性。MSC 培養(yǎng)誘導的 AGAP2-AS1 通過激活 FAO 調節(jié)干性和曲妥珠單抗抗性。從機制上講,AGAP2-AS1 與 HuR 相關,且 AGAP2-AS1 - HuR 復合物可直接與 CPT1 結合,通過提高 RNA 穩(wěn)定性增加其表達。此外,AGAP2-AS1 可通過海綿作用 miR- 15a-5p 釋放 CPT1 mRNA,發(fā)揮 ceRNA 的作用;臨床上,血清 AGAP2-AS1 表達升高預示乳腺癌患者對曲妥珠單抗治療反應不良。綜上所述,MSC 培養(yǎng)誘導的 AGAP2-AS1 通過促進 CPT1 表達和誘導 FAO 引起干性和曲妥珠單抗抗性。研究結果為 MSCs 在曲妥珠單抗耐藥中的作用提供了新的思路,而 AGAP2-AS1 可能成為 HER-2+ 乳腺癌患者的預測生物標志物和治療靶點。



5

標題:臍帶間充質干細胞來源的外泌體 lncRNA H19 通過 miR-29b-3p/FoxO3 軸提高骨軟骨活性

期刊:Oncogene

影響因子:7.919

發(fā)表時間:2021.01

單位:同濟大學醫(yī)學院附屬上海市第十人民醫(yī)院

摘要:前期研究發(fā)現,來自臍帶間充質干細胞(UMSCs) 的外泌體 lncRNA H19 在骨軟骨再生中發(fā)揮著關鍵作用,在本研究中,研究了外泌體 lncRNA H19 是否可以作為競爭性內源性 RNA (ceRNA) 增強軟骨細胞中的骨軟骨活性。通過雙熒光素酶報告基因檢測、RNA pull-down、RNA 免疫沉淀(RIP) 和熒光原位雜交(FISH) 驗證 miR-29b-3p 與 lncRNA H19 和靶 mRNA FoxO3 之間的相互作用。軟骨細胞用 lncRNA H19 高表達的 umsc 來源的外泌體處理,然后進行凋亡、遷移、衰老和基質分泌評估,通過 SD 大鼠軟骨缺損體內模型,探討 lncRNA H19/miR-29b-3p 的作用及機制。外泌體顯示出將 lncRNA H19 轉移到軟骨細胞的能力,從機制上講,外泌體 lncRNA H19 作為 miR-29b-3p 競爭的內源性海綿增強了骨軟骨活性,而 miR-29b-3p 直接靶向 FoxO3。關節(jié)內注射過表達 lncRNA H19 的外泌體可促進持續(xù)軟骨修復;然而,miR-29b-3p agomir 可能會削弱這一作用。研究揭示了過表達 lncRNA H19 的 umsc 來源的外泌體在制定對抗軟骨缺損機制方面的重要作用,研究發(fā)現,外泌體 H19 在體內和體外均能促進軟骨細胞遷移、基質分泌、凋亡抑制和衰老抑制。其具體機制是外泌體 H19 作為 ceRNA 對抗 miR-29b-3p,上調軟骨細胞中的 FoxO3。


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