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microRNA 與靶基因網絡圖

Demo 結果

圖中顯示了 microRNA 與 mRNA 之間的關系

結果解讀

結果中顯示了 microRNA 與 mRNA 之間的關系,圖中 microRNA 調控的靶基因越多,說明 microRNA 影響了這一群靶基因的功能;靶基因被多個 microRNA 調控,說明該基因為核心的基因。


microRNA 與靶基因網絡圖介紹

將顯著性功能與顯著性 Pathway 所包 含的靶基因取交集后與 microRNA 構建 microRNA 靶基因調控網絡,可以在全局的水平上直觀的反應基因之間的相互關系,同時反映了基因調控網絡的穩定性。根據網絡中 microRNA 的位置函數計算出 microRNA 在網絡中的關系強度,即 microRNA 的網絡特征值。特征值高 microRNA 處于網絡的樞紐性地位,該 microRNA 調控能力強,對網絡結構和樣本性狀有重要的調控價值,同時從網絡中也可以得到被 microRNA 調控的關鍵靶基因。

分析要求

microRNA 進行靶基因預測并且對靶基因進行篩選后。

提供結果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進行細節調整;

3、文本文件:microRNA 與靶基因的關系,microRNA 與靶基因的核心基因篩選。

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