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伯豪生物
10x | 單細胞 RNA 測序
 電子資料 調研問卷


10x Genomics

儀器平臺

10x Genomics 公司的 Chromium 系統(tǒng)利用 8 通道的微流體“雙十字”交叉系統(tǒng),將含 barcode 的凝膠珠(Gel Beads)、細胞和酶的混合物、油三者混合,形成 GEMs(油包水的微體系)。GEMs 形成后,細胞裂解,凝膠珠自動溶解釋放大量 barcode 序列,隨后 mRNA 逆轉錄產生帶有 10x barcode 和 UMI 信息的 cDNA,構建標準測序文庫,其中 10X barcode 用于區(qū)分細胞,UMI 用于區(qū)分 mRNA 分子。

單細胞 RNA 測序 10Xgenomics 技術原理

圖 10X genomics 技術原理

伯豪生物提供:單細胞轉錄組測序、生信分析整體科研技術服務,伯豪生物單細胞轉錄組測序科研服務商,24 小時咨詢服務熱線:021-58955370

伯豪優(yōu)勢 3

1、通量高: 一張芯片具有 8 個獨立的通道,可供 8 個樣本同時上機,每個通道可捕獲 10000 個細胞。

2、捕獲率高: 單細胞捕獲效率高達 65%,多細胞比例 <0.9%(1,000 個細胞中)。

3、延展性強: 除了獲得單細胞 mRNA 的信息,還提供了單細胞 TCR/BCR、單細胞表面蛋白、單細胞 ATAC 等多種解決方案。


技術參數(shù)

  文庫結構

10X Genomics 3’gene expression 文庫示意圖

圖 10X Genomics 3’gene expression 文庫示意圖

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建議測序深度及參數(shù)

指標

參數(shù)

測序深度

50,000~100,000 reads/cell

測序類型

PE150

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樣本要求

1、類型:新鮮組織,原代細胞,細胞系等。

2、來源:血液提取、磁珠富集、流式富集、組織解離等。

3、樣本量及其它質控要求:

樣本類型 樣本質控要求
細胞懸液 >105 目標細胞個數(shù)(底限 10,000 個細胞);
活率 >80%;
濃度 500-1,000 個細胞 /ul;
細胞間無粘連(成團率 <5%);
無大于 40μm 的細胞碎片或其他顆粒物;
不存在逆轉錄抑制劑和非細胞的核酸分子。
血液 EDTA 抗凝的全血(不可肝素抗凝),>5ml。
組織 0.3cm×0.3cm(不超過 0.5cm×0.5cm)的新鮮組織,4~5 塊。

4、保存運輸:

(1)細胞懸液:建議現(xiàn)場制備,如要運輸,建議使用伯豪生物自主研發(fā)的單細胞保護液,4°C 運輸,48 小時內送達伯豪生物實驗室。

(2)血液:EDTA 抗凝的全血,4°C 運輸,2 小時內送達伯豪生物實驗室;或提取 PBMC 后凍存,干冰運輸。

(3)組織:建議使用伯豪生物自主研發(fā)的單細胞組織保護液,4°C 運輸,48 小時內送達伯豪生物實驗室。

伯豪生物提供:單細胞轉錄組測序、生信分析整體科研技術服務,伯豪生物單細胞轉錄組測序科研服務商,24 小時咨詢服務熱線:021-58955370


電子資料

序號 文件類型 查閱
1 【畫冊】單細胞測序解決方案 點擊查看
2 【畫冊】石蠟樣本(FFPE)單細胞轉錄組測序解決方案 點擊查看



協(xié)助客戶發(fā)文


﹂數(shù)據來源:互聯(lián)網「2015 年 -2024 年」上海伯豪生物技術有限公司協(xié)助客戶項目發(fā)文。




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