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伯豪生物
SMART | 單細胞 RNA 測序
 電子資料 調研問卷

伯豪生物官網 www.wokopo.com.cn 新官網消息 單細胞 RNA 測序科研服務來了

SMART-seq

儀器平臺

2012 年,由美國和瑞典的科學家共同開發了稱為 Smart-Seq(Switching mechanism at 5’end of the RNA transcript)的技術 [1]。在 2013 年,Nature Methods 雜志上報告了新的方案,被稱為 Smart-Seq2[2],隨后在 2014 年他們有公布了詳細的操作流程 [3]。獲取單細胞并裂解細胞后,含有 oligo-dT 的引物與 mRNA 的 poly- A 結合,逆轉錄酶 MMLV 進行逆轉錄,逆轉錄酶到達 mRNA 5’末端時,MMLV 的末端轉移酶活性會在一鏈 cDNA 的 3'末端增加額外的胞嘧啶,這時 TSO 引物 3' 末端的 rGrG+ G 結合到首鏈末端的胞嘧啶,然后以首鏈 cDNA 為模版進行延伸合成互補的第二鏈,全長 cDNA 經過 PCR 擴增后進一步進行測序文庫的構建。

技術原理

伯豪生物單細胞 RNA 測序服務 SMART-seq2 技術原理


▲SMART-seq2 技術原理

伯豪生物提供:單細胞轉錄組測序、生信分析整體科研技術服務,伯豪生物單細胞轉錄組測序優研服務商,24 小時咨詢服務熱線:021-58955370

伯豪優勢

1、起始量低:1 個細胞起始,適用于難以滿足 10X Genomics 等平臺起始細胞量要求的樣本。

2、覆蓋度高: 測序覆蓋 cDNA 的全長序列,每個細胞能夠獲得上萬個基因的表達。

3、信息個性化: 除了獲得基因表達信息,數據能夠用于可變剪接,cSNP 等分析,以及帶 poly- A 結構的 lncRNA 研究。

伯豪生物提供:單細胞轉錄組測序、生信分析整體科研技術服務,伯豪生物單細胞轉錄組測序科研服務商,24 小時咨詢服務熱線:021-58955370

技術參數

文庫結構

單細胞 RNA 測序 SMART-seq2 文庫結構

圖 SMART-seq2 文庫示意圖

伯豪生物提供:單細胞轉錄組測序、生信分析整體科研技術服務,伯豪生物單細胞轉錄組測序科研服務商,24 小時咨詢服務熱線:021-58955370

建議測序深度及參數

指標

參數

測序深度

6Gb/cell

測序類型

PE150

伯豪生物提供:單細胞轉錄組測序、生信分析整體科研技術服務,伯豪生物單細胞轉錄組測序科研服務商,24 小時咨詢服務熱線:021-58955370

樣本要求

1、類型:新鮮組織,原代細胞,細胞系等。

2、來源:血液提取、磁珠富集、流式富集、組織解離等。

3、樣本量:單個細胞(或微量細胞)。

4、保存運輸:細胞放入 SMART-seq 試劑盒指定的裂解液中,-80°C 保存,干冰運輸。


電子資料

序號 文件類型 查閱
1 【畫冊】單細胞全長轉錄本測序解決方案 點擊查看
2 【畫冊】石蠟樣本(FFPE)單細胞轉錄組測序解決方案 點擊查看
3 【畫冊】單細胞測序解決方案 點擊查看


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