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伯豪生物
單細胞核 RNA 測序
 電子資料 調(diào)研問卷

技術簡介

伯豪生物官網(wǎng) www.wokopo.com.cn 新消息 單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序技術服務來了

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是從組織抽提細胞核,然后在單個細胞核水平上對轉(zhuǎn)錄組進行高通量測序分析的一項新技術,通過檢測單個細胞核的基因表達狀態(tài),進而揭示細胞間的異質(zhì)性。

伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

實驗流程

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序科研流程圖

伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

冷凍樣本和難消化樣本的解決方案

1、適用于凍存組織樣品;克服新鮮樣品時效性限制;

2、適用于難以制備單細胞懸液的組織樣品;

3、減少解離偏差,能更好地保留細胞類型多樣性;

4、不需要酶促消化,真實反映細胞的組分。

伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

伯豪優(yōu)勢

1、高質(zhì)量抽核:抽核經(jīng)驗豐富,針對不同組織優(yōu)化了解決方案;

2、標準化內(nèi)控:豐富的實操經(jīng)驗構建了標準化的內(nèi)控體系;

3、流程化分析:完善的分析流程,準確快速解析單細胞核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù);

4、專業(yè)的團隊:專業(yè)的技術團隊具有多年項目方案設計、實驗操作、售后分析等經(jīng)驗;

5、全流程服務:提供組織抽核、單細胞核捕獲、反轉(zhuǎn)錄、建庫測序及數(shù)據(jù)分析的全套服務。

伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

樣本要求

1、組織用量:黃豆粒大小 1 塊;

2、樣本處理:組織液氮速凍,-80℃保存;

3、質(zhì)量要求:組織 RNA 無降解,RIN≥7;

4、運輸方式:干冰運輸。

伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

應用領域

冷凍樣本;FFPE 樣本; 通過消化難拿到高質(zhì)量的單細胞懸液的組織類型。

伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

研究成果

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 1

小鼠肝臟單細胞核

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 2


人松果體單細胞核

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 3


小鼠大腦皮層單細胞核

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 4

小鼠心臟組織細胞核 RNA 質(zhì)檢(RIN=8.9)

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 5

PCR 驗證組織與細胞核、組織與消化細胞的差別(0 為相同)

結(jié)論:

小鼠大腦皮層,相比于消化細胞,細胞核的表達情況更接近于原始組織樣本。

伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

【單細胞轉(zhuǎn)錄組測序】VS【單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序】結(jié)果對比

1、隨著測序深度的不斷增加,單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序(snRNA-seq)和單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq)得到的基因數(shù)相近。

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 6

Single-cell DropSeq scDropSeq


2、單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序在細胞分群上與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序沒有區(qū)別

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 7

單細胞核數(shù)據(jù)分群結(jié)果 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分群結(jié)果

3、單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序可有效挖掘稀有細胞類型

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 8

單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序可以減少組織消化引起的偏差


4、單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果中發(fā)現(xiàn)較少壓力相關基因的表達

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)圖 9

參考文獻

[1]Habib, Naomi, Avraham-Davidi, Inbal, Basu, Anindita,?et al. Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq[J]. Nature Methods, 2017, 14(10):955-958.

[2]?Wu, Haojia, Kirita, Yuhei, Donnelly, Erinn L, 等。Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis[J]. Journal of the American Society of Nephrology, 2018.


電子資料

序號 文件類型 查閱
1 【畫冊】單細胞全長轉(zhuǎn)錄本測序解決方案 點擊查看
2 【畫冊】石蠟樣本(FFPE)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序解決方案 點擊查看
3 【畫冊】單細胞測序解決方案 點擊查看


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