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Pathway-Network

Demo 結果

本圖表達了顯著性 pathway 之間的關系

結果解讀

圖中表明了顯著性 pathway 之間的關系以及發現受實驗影響的核心 Pathway。


信號通路調控網絡構建(Pathway-Network)介紹

根據所有差異基因同時參與的 Pathway 之間的相互調控關系構建信號通路調控網絡,從系統的角度研究各個信號通路間的信號傳導和調控過程,在多個顯著性 Pathway 中發現受實驗影響的核心 Pathway, 以及實驗影響的信號通路之間的調控機理。

分析要求

KEGG 富集分析的結果或者感興趣的 KEGG 中的 pathway(pathway 個數大于 10)。

提供結果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進行細節調整;

3、文本文件:pathway 之間的關系以及每個 pathway 對應的 indegree,outdegree。

-END-



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