今年 6 月，美國 MD 安德森癌癥中心在 Nature 發(fā)文 [1]，研究者利用單細胞空間組技術(shù)對 126 名婦女，超過 714,000 個細胞進行了分析。構(gòu)建了目前為止最大且最全面的人類乳腺細胞圖譜（Human Breast Cell Atlas，HBCA），該圖譜突出了 12 種主要細胞類型和 58 種生物細胞狀態(tài)，為研究乳腺生物學(xué)和乳腺癌等疾病提供了參考。
去年，BioRxiv 發(fā)文 [2]，研究人員對乳腺癌 FFPE 樣本進行連續(xù)切片，使用單細胞基因表達（Chromium Flex，scFFPE-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（Visium CytAssist）和原位雜交技術(shù)（Xenium In Situ）進行檢測，利用三種技術(shù)協(xié)同解析了乳腺癌腫瘤微環(huán)境，揭示了細胞異質(zhì)性，促進了對導(dǎo)管原位癌（DCIS）腫瘤浸潤的全面研究。
空間組學(xué)技術(shù)能夠解析轉(zhuǎn)錄本在組織的不同空間位置的表達特征。而 Xenium 亞細胞空間原位分析技術(shù)，極大地提高了空間上的分辨率，在組織異質(zhì)性、免疫微環(huán)境等領(lǐng)域應(yīng)用前景廣闊。但仍有很多同學(xué)老師還會有各種疑惑： 空間轉(zhuǎn)錄組及空間原位分析技術(shù)的原理是什么？有哪些具體應(yīng)用案例？如何從案例中提取相關(guān)知識與自己的實驗研究方案相結(jié)合？
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主題一：空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)全流程解析
1. 空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理介紹
2. 空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)實驗技巧與要點
3. 經(jīng)典案例 - 看空間組學(xué)如何實現(xiàn)單細胞多維度分析
主題二：亞細胞空間原位分析技術(shù)：原理、應(yīng)用與案例解析
1.Xenium 原位分析原理及應(yīng)用特點
2.Xenium 技術(shù)與空間轉(zhuǎn)錄組 Visium 技術(shù)如何選
3. 基于 Xenium 技術(shù)方案的經(jīng)典案例解析
參考文獻
[1]. Kumar, Tapsi et al.“A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breast.”Nature?vol. 620,7972 (2023): 181-191.
[2]. High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue.https://doi.org/10.1101/2022.10.06.510405
